Heterodyplex Analizi : Farklı kaynaklardan gelen DNA kollarının oluşturduğu DNA bu (DNA) larına farklılaştığı yerlerde baloncuklar ve loplar yapar. Böyle Heterogen DNA Heteroduplex olarak adlandırılır. Bu DNA’nın elektron mikroskop analizi rekombinant DNA çalışmalarında önemli araçdır.